Обновление технической базы в авиакомпании, сделало возможным развитие социально важного направления. Именно «АэроГео» стало первым перевозчиком в крае, предоставившим свои авиасуда для нужд санитарной авиации. С 2009 года выполняются полеты в целях оказания экстренной медицинской помощи населению Красноярского края, республик Хакасия и Тыва. Изначально для санавиации использовались вертолеты Ми-2 и Ми-8Т, но с появлением в парке авиакомпании высококлассных американских самолетов Cessna 208B Grand Caravan, швейцарского самолета Pilatus pc12/47, вертолетов Robinson (США) и Eurocopter (Франция), экстренная медицинская помощь стала более мобильной, что позволяет спасать сотни жизней.